Αρνητική ήταν η απόφαση της τουρκικής Δικαιοσύνης, επί της προσφυγής, με την οποία εζητείτο η Αγία Σοφία από Μουσείο να μετατραπεί σε τζαμί.
Το Συνταγματικό Δικαστήριο της Τουρκίας έκρινε ότι δεν υπάρχει λόγος ν αποδεχτεί το αίτημα της Ένωσης Υπηρεσίας Μόνιμων Βακουφίων Ιστορικών Μνημείων και Περιβάλλοντος για να μετατραπεί η Αγία Σοφία από μουσείο σε τζαμί.
Η συγκεκριμένη Ένωση είχε προσφύγει το 2004 προκειμένου να ανοίξει η Αγία Σοφία σε μουσουλμανική προσευχή αλλά δεν πήρε ποτέ απάντηση.
Ακολούθησε η προσφυγή το 2005 στο Συμβούλιο της Επικρατείας το οποίο απέρριψε το αίτημα της Ένωσης. Οι υπεύθυνοι της Ένωσης, ωστόσο, το 2015 προσέφυγαν στο Συνταγματικό Δικαστήριο με τον ισχυρισμό πως η άρνηση στο αίτημα να επιτραπεί η προσευχή στην Αγία Σοφία παραβιάζει τη θρησκευτική ελευθερία.